MANE Select是指每个人类蛋白编码基因的一个“代表性转录本”，由NCBI和EMBL-EBI联合确定

MANE Select是指每个人类蛋白编码基因的一个“代表性转录本”，由NCBI和EMBL-EBI联合确定，用于标准化基因研究和临床报告。

定义与作用

MANE是Matched Annotation from NCBI and EMBL-EBI的缩写，旨在为每个人类蛋白编码基因提供一个统一的参考转录本。MANE主要分为两个集合：MANE Select和MANE Plus Clinical。其中，MANE Select由计算机预测和专家人工审核生成，每个基因只选一个代表性转录本，通常作为临床报告、基因组浏览器默认配置和实验研究的标准转录本。 

MANE Select的特点

• 代表性：该转录本在表达量、保守性和功能上最具代表性。 

  
  

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• 标准化：在NCBI和Ensembl数据库中均被认定为主要转录本，便于跨数据库一致性查询。 

  
  

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• 临床适用：适合作为临床变异报告的默认转录本，保证研究和诊断的一致性。 

  
  

  
  

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与其他数据库的关系

• NCBI RefSeq：MANE Select通常对应RefSeq中的一个完整转录本（complete CDS），便于实验设计和功能研究。 

  
  

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• UniProt：MANE Select转录本对应的蛋白质序列可作为UniProt的canonical序列，确保跨数据库的蛋白质注释一致性。 

  
  

  
  

  
  

选择MANE Select的理由

1. 主要表达：该转录本通常是细胞中表达量最高的。 

   
   

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2. 保守性高：在不同物种中具有较高的同源性，便于比较研究。 

   
   

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3. 功能完整：编码区完整，适合功能实验和蛋白质结构分析。 

   
   

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4. 实验便利：使用MANE Select可减少因选择不同转录本而导致的实验差异。 

   
   

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补充说明

对于某些基因，MANE Select可能不足以覆盖所有临床相关变异，这时可参考MANE Plus Clinical集合，包含组织特异性或特殊功能的转录本。在没有MANE Select标注的情况下，可参考最长ORF转录本或APPRIS P1标注的主要转录本作为替代。 

总之，MANE Select提供了一个可靠、标准化的基因转录本选择方案，在基因功能研究、过表达实验和临床变异分析中被广泛采用。