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做 miRNA 靶基因研究,选择哪个载体合适?


pmirGLO Dual-Luciferase miRNA Target Expression Vector(E1330)是为 miRNA 靶标研究而设计的载体,可通过将 miRNA 的靶序列插入到主报告基因萤火虫萤光素酶基因(luc2)的下游或者 3’端而实现。萤火虫萤光素酶表达的下降意味着内源性的或外源引入的 miRNA 与克隆的 miRNA 的靶序列发生了结合。这一载体是基于 Promega 的双报告基因技术,萤火虫萤光素酶基因(luc2)作为主报告基因,用于监控 miRNA 的调节,海肾萤光素酶基因(hRluc-neo)作为内参 报告基因,用于进行归一化处理和稳定转染的筛选标记。

 


与 psiCHECK™-2 载体相比有以下特点/优点:pmirGLO 载体主报告基因所带的启动子 PGK 为中等强度的启动子;载体上带有 Neo 抗性基因,可作为稳定转染筛选标记;主报告基因为萤火虫萤光素酶基因,更符合大部分人的使用习惯。 psiCHECK™-2 Vector(C8021)最初是为验证 siRNA 靶标设计的。该载体用海肾萤光素酶(hRluc)作为主报告基因;萤火虫萤光素酶(hluc+)则作为内参 报告基因,用于进行归一化处理。目的基因被克隆至海肾萤光素酶翻译终止密码子下游的多克隆位点。由合成的 siRNA 或体内表达的 shRNA 引发的针对目的基因的 RNAi 过程,导致融合 mRNA 的剪切和随后的降解。

也有文章中用 psiCHECK-2 进行 miRNA 研究。但与 pmirGLO 载体相比,有以下两个缺憾:1. 酶切位点少;2. SV40 启动子活性高,用于调节效果明显的 siRNA 可行,而当 miRNA 抑制作用比较弱时,不容易观察到明显的变化。由于 miRNA 的调节作用通常是微量调节,使用中等强度启动子驱动报告基因表达的载体(如 pmirGLO 载体)通常更合适一些。



miRNA 靶基因 3'UTR 验证:首选 pmirGLO;特殊场景用 psiCHECK™-2

核心区分:pmirGLO 原厂专为 miRNA 靶向设计,psiCHECK2 原本是 siRNA/Ri 干扰载体,二者主 / 内参荧光基因完全相反。

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pmirGLO图谱

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psiCHECK2图谱

一、元件核心区别(最关键)

1. pmirGLO(推荐常规 miRNA 验证)

  • 主报告:萤火虫 Luc2(PGK 中等启动子),3' 端 MCS 插靶基因 3'UTR;miRNA 结合→萤火虫荧光下降Promega Corporation

  • 内参:海肾 hRluc(SV40 驱动)+Neo⁺抗性,用于归一化,可稳筛稳定细胞株

  • 启动子 PGK强度适中,不会因启动子过强掩盖 miRNA 微弱抑制效果,数据更贴合体内生理调控水平

  • 载体全长~7.35kb,氨苄抗性,酶切位点丰富(XhoI/NheI/SacI/XbaI),克隆便捷

计算公式:Firefly/Renilla,比值下降 = 靶向成立(科研通用统计格式)

2. psiCHECK™-2(siRNA 原生载体,小众 miRNA 用)

  • 主报告:海肾 hRluc(SV40 强启动子),终止子下游 MCS 插 3'UTR;miRNA 结合→海肾荧光下降

  • 内参:萤火虫 hluc(HSV-TK),无 Neo 抗性,不能稳定株筛选,仅瞬时转染

  • SV40 强启动子驱动海肾,本底表达极高,弱抑制型 miRNA 极易看不出差异,数据波动大

  • 全长~6.27kb,氨苄抗性,可用酶切偏少(XhoI/NotI 最常用)

计算公式:Renilla/Firefly,和绝大多数文献统计格式相反

二、选型对照表(直接对照实验需求)

表格




实验需求优先 pmirGLO优先 psiCHECK‑2
常规 miRNA-3'UTR 靶向验证(毕业论文 / 基础机制)✅首选,90% 文献通用❌不推荐
需要构建稳定细胞株长期验证✅自带 Neo,G418 筛稳转❌无筛选标记,只能瞬转
miRNA 抑制幅度偏弱(<30% 下调)✅PGK 弱启动子,抑制差异易检出❌强启动子掩盖微弱下调
做多拷贝串联靶位点(4×miRNA 结合序列)✅MCS 位点多、承载片段友好✅载体偏小,多串联也能用
同时做 siRNA 干扰 + miRNA 两套实验✅原生 siRNA 载体,一质粒两用
发文需要匹配高分杂志常规统计范式✅Firefly/Renilla 是通用格式❌比值格式非主流

三、使用实操建议

✅绝大多数情况选 pmirGLO

  1. 靶基因 3'UTR 插入Luc2 终止密码子下游 MCS;

  2. 质粒 + miRNA mimic/NC 共转 293T / 目的细胞,24~48h 裂解测双荧光;

  3. 野生 UTR 组比值<突变 UTR 组 = 直接靶向。

⚠️仅 2 种情况用 psiCHECK‑2

  1. 课题同时做 siRNA 靶点筛选 + miRNA 验证,不想备两套载体;

  2. 实验室长期习惯海肾做主报告、已有成熟 psiCHECK‑2 实验体系。

四、补充小提示

  1. 若后续要稳转细胞验证内源 miRNA,只能 pmirGLO(Neo 抗性是硬性刚需);

  2. 市面上老文献大量用 psiCHECK2 做 miRNA 是历史沿用,近 5 年新课题主流全部换成 pmirGLO。