Strain: BY4743

Genomic DNA fromSaccharomyces cerevisiae strain BY4743 - 201390D-5 | ATCC

• Status

• Other

• Genotype

• MATa/α his3Δ1/his3Δ1 leu2Δ0/leu2Δ0 LYS2/lys2Δ0 met15Δ0/MET15 ura3Δ0/ura3Δ0

• Description

• Strain used in the systematic deletion project, generated from a cross between BY4741 and BY4742, which are derived from S288C. As in S288c, this strain as well as haploid derivatives BY4741, and BY4742 have allelic variants of MIP1, SAL1 and CAT5 and these polymorphisms, described in the respective locus history notes for these genes (MIP1, SAL1 and CAT5) all contribute to the high observed petite frequency.

产品介绍

产品信息

宿主

酵母菌

商品描述

一组独特的敲除菌株，覆盖了酵母基因组的96%，包含6000多个带有分子条形码的基因破坏突变体。

酵母敲除突变体的诞生

酵母敲除菌株采用基于PCR的策略系统性地创建（见参考文献3）。通过两次连续的PCR反应——第一次是结合适当标签并赋予抗生素耐药基因，第二次是结合有丝分裂重组位点——每个ORF被KanMX盒取代，采用同源重组。该方法使超过95%的ORF被敲除。每个盒包含一个独特的20碱基对核苷酸DNA序列，称为“分子条码”，支持平行分析。还包含一组常见的侧翼DNA标签序列，允许对独特标签进行扩增。

酵母敲除突变体的诞生酵母敲除菌株采用基于PCR的策略系统性地创建（见参考文献3）。通过两次连续的PCR反应——第一次是结合适当标签并赋予抗生素耐药基因，第二次是结合有丝分裂重组位点——每个ORF被KanMX盒取代，采用同源重组。该方法使超过95%的ORF被敲除。每个盒包含一个独特的20碱基对核苷酸DNA序列，称为“分子条码”，支持平行分析。还包含一组常见的侧翼DNA标签序列，允许对独特标签进行扩增。

Saccharomyces基因组缺失项目（见参考文献1）开发了一个独特的敲除菌株集合，覆盖了96%的酵母基因组。这批包含6000多个基因破坏突变体†为酵母基因组的功能分析提供了独特工具。包含不同的标签——或称“分子条码”——来识别每个菌株，使得表型分析可以基于单一基因或全基因组尺度进行（见参考文献2）。通过使用酵母敲除菌株进行功能剖析，还可以通过类比收集大量关于人类基因功能的信息。Open Biosystems为你提供了酵母敲除菌株（YKO）的资源，这是理解基因功能的宝贵资源。

亮点

• 6000个独立基因分布在四个背景中，产生超过20,000个不同的敲除菌株

• 分子条形码允许对基因功能的并行分析

• 可通过测序或全基因组方法进行个体分析

• 全基因缺失确保功能丧失

酵母敲除菌株基因型

酵母敲除突变体的诞生

酵母敲除菌株采用基于PCR的策略系统性地创建（见参考文献3）。通过两次连续的PCR反应——第一次是结合适当标签并赋予抗生素耐药基因，第二次是结合有丝分裂重组位点——每个ORF被KanMX盒取代，采用同源重组。该方法使超过95%的ORF被敲除。每个盒包含一个独特的20碱基对核苷酸DNA序列，称为“分子条码”，支持平行分析。还包含一组常见的侧翼DNA标签序列，允许对独特标签进行扩增。

酵母敲除突变体的诞生酵母敲除菌株采用基于PCR的策略系统性地创建（见参考文献3）。通过两次连续的PCR反应——第一次是结合适当标签并赋予抗生素耐药基因，第二次是结合有丝分裂重组位点——每个ORF被KanMX盒取代，采用同源重组。该方法使超过95%的ORF被敲除。每个盒包含一个独特的20碱基对核苷酸DNA序列，称为“分子条码”，支持平行分析。还包含一组常见的侧翼DNA标签序列，允许对独特标签进行扩增。

通过两次连续的PCR反应——第一次是结合适当标签并赋予抗生素耐药基因，第二次是结合有丝分裂重组位点——每个ORF被KanMX盒取代，采用同源重组。该方法使超过95%的ORF被敲除。

尽早开始用酵母菌敲除筛查

通过分析每种突变株在特定条件下表现出的表型变化，可以获得基因功能作用的证据。虽然这种分析过去曾通过传统基因筛选或随机诱变进行，但酵母基因敲除菌株相比这两种方法具有优势。

一个优点是，酵母突变株的表型反映了该基因的功能完全丧失，而经典方法无法保证这一点。此外，与传统筛选不同，基因鉴定是事先已知的，从而避免了确定责任基因的繁琐任务。

同时也省去了制作单一酵母敲除菌株所需的时间和繁琐。基因组中几乎所有酵母基因都有一个敲除菌株，所以你只需请求感兴趣的菌株即可。

分子条形码促进全基因组方法

突变酵母菌株也可以通过测序或全基因组方法单独分析。分子条形码允许利用寡核苷酸阵列对基因功能进行平行分析。通过计算该菌株DNA的丰度，可以确定某一品株在特定条件下的适应度。这是通过印有检测分子条码存在所需的互补标签序列的寡核苷酸阵列实现的（见参考文献1和2）。

斯坦福大学的Saccharomyces基因组数据库（SGD）提供了丰富的信息——包括遗传和物理图谱以及DNA序列信息。

注释

† 虽然>6,000代表单个基因的数量，但存在四个背景（MATa和MATα单倍体、杂合二倍体和纯合二倍体），且有多种基因分布于多个背景，从而产生超过20,000个敲除菌株。

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航运信息

单个酵母敲除菌株以活培养形式在2毫升管中提供。每管含有含G418的YPD汤（200 μg/mL），并补充15%甘油。在收到订单后3到4天内，我们将通过快递以室温方式发送您的克隆品。将高汤克隆品在4°C下保存最长一周，或无限期保存-80°C。

酵母敲除液以96孔板中的冷冻甘油高汤形式提供。甘油菌株是YPD培养基中的酵母敲除液和甘油的培养物。这些板材以干冰运输，可在-80°C下无限期维持。

Saccharomyces cerevisiae (ATCC® 201390™) 

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