全质粒测序服务

概览

我们充分理解在进行下游研究之前确保正确的质粒序列的重要性。

我们的全质粒测序服务提供了全面的测序平台，结合卓越的读取质量和长度，确保您获得准确而详细的关于整个质粒基因组成的洞察，助力您在研究中取得突破性的进展。

服务优势

快至48小时交付 高准确度   全面的测序平台

服务内容

Next-Generation Sequencing (NGS)

订购讯息

交付内容

• excel 报告: 包含测序数据量、质控结果、比对结果、变异结果

• pdf 报告：将excel中的关键结果、具体的变异位点以及质粒测序深度模式图整合生成该报告

• gbk 文件：由 pLannotate注释生成包含质粒中每个原件的GenBank 文件

* 联系我们索取样本报告

Oxford Nanopore Technologies (ONT)

订购讯息

交付内容

• Nanopore_result.pdf: 原始数据的质量控制结果，参考序列的比对结果，和变异检测结果

• Nanopore_result.xlsx: 原始数据的质量控制结果、变异检测结果、每个位点的测序深度，和检测到的碱基类型的统计数据

• vars_pLann.gbk: 质粒功能元素（由pLannotate注释）、变异检测结果（包括结构变异）和参考序列组成

• pLann.html: 质粒示意图

• .final.fa : 重建的DNA序列用突变碱基替代参考序列中的碱基，只有具有高置信度且突变频率大于60%的突变才用于替代

• NanoPlot-report.html: 由NanoPlot生成的原始数据的质量控制结果

• .fastq file: raw data: 联系我们索取

* 联系我们索取样本报告

常见问题解答 (FAQ)

• 1. 收样标准？

  NGS收样标准

  质粒长度 (bp)	浓度	容量
  ≤ 5kb	10 ng/μL	≥20 μL
  5-20kb
  20-35kb

  溶剂：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶剂中不能含有EDTA）
  浓度：	浓度必须采用Qubit，不能使用Nanodrop进行检测
  纯度：	建议 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送测样本必须是单克隆质粒，若是混合物，可能会造成结果不准确
  完整度：	建议采用琼脂糖凝胶电泳对质粒进行检测，判断是否存在降解情况，质粒降解可能会造成测序失败
  寄送方式：	干冰

  Nanopore收样标准

  质粒长度 (bp)	浓度	容量
  ＜20 kb	30 ng/μL	≥10 μL
  20-100 kb	50 ng/μL	≥20 μL
  100-300 kb	50 ng/μL	≥40 μL

  溶剂：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶剂中不能含有EDTA）
  浓度：	浓度必须采用Qubit，不能使用Nanodrop进行检测
  纯度：	建议 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送测样本必须是单克隆质粒，若是混合物，可能会造成结果不准确
  完整度：	建议采用琼脂糖凝胶电泳对质粒进行检测，判断是否存在降解情况，质粒降解可能会造成测序失败
  寄送方式：	干冰