做科研最怕的不是没有思路，而是查资料、找工具、对信息这几步反复横跳。这期我们分享一些常用的科研网站，知道它适合用来干什么、什么时候该打开它。

1. NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)

NCBI是一个把多种生物医学数据库和检索入口整合在一起的平台，常用资源包括 PubMed、基因/基因组与序列相关库等。它支持跨库检索与互相链接，并提供 BLAST、数据集下载与 API 等工具，方便检索、比对和批量获取数据。适合做序列查询、基因注释溯源、数据下载与文献关联检索。

图片来源：NCBI官网

2. 国家生物信息中心(www.cncb.ac.cn)

国家生物信息中心(CNCB)定位为生物信息数据的汇交、存储与管理平台，并支撑相关前沿研究与转化应用。其体系中包含国家基因组科学数据中心(NGDC)等数据基础设施与多类数据库/工具，面向组学数据归档、共享与计算支撑。常用于国内合规的数据递交、组学数据存取、以及访问国内主建数据库与平台服务。

图片来源：CNCB官网

3. PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/)

PubMed是免费的生物医学与生命科学文献检索平台，收录数千万条文献题录与摘要，并常提供指向全文的链接，它支持高级检索、筛选器与临床查询等功能，便于系统性检索与快速定位证据。常用于课题背景调研、写作引用、以及针对某个基因/病原/方法的最新研究追踪。

图片来源：PubMed官网

4. Ensembl(https://www.ensembl.org/index.html)

Ensembl是开放的基因组浏览与注释平台，提供多物种基因组、统一注释体系与一整套查询工具。你可以在浏览器中查看基因结构、转录本、保守性、变异等信息，也能做比较基因组层面的跨物种查询。它同时支持程序化访问，适合批量提取坐标、注释与变异数据。

图片来源：Ensembl官网

5. GeneCards Suite(https://www.genecards.org/)

GeneCards是以人类基因为中心的整合型数据库，把分散在众多来源的基因相关信息汇总到一张gene card里。内容通常涵盖基因功能、表达、蛋白信息、变异、疾病关联与功能注释等，便于快速形成对某个基因的全景认识。适合做候选基因背景调研、功能与疾病关联初筛，以及为后续文献检索和实验设计提供线索。

图片来源：GeneCards Suite官网

6. UniProt(www.uniprot.org)

UniProt 是蛋白质序列与功能注释的核心资源库，提供高质量、结构化的蛋白功能信息汇总。你可以按蛋白名/基因名/物种/功能关键词等检索，并查看功能注释、结构域、翻译后修饰、定位与大量交叉链接。它也提供 API/程序化访问，便于批量检索与下游分析对接。

图片来源：UniProt官网

7. ExPASy(www.expasy.org)

ExPASy 是SIB(瑞士生物信息学研究所)的生信资源门户，汇集多种高质量数据库与在线分析工具。它提供常用的小工具入口，例如核酸翻译成蛋白(Translate)、蛋白理化性质计算(ProtParam)等，适合快速做序列层面的基础分析。也常作为查找结构建模等其他工具入口的导航站。

图片来源：ExPASy官网

8. PDB(www.rcsb.org)

RCSB PDB提供Protein Data Bank的三维结构数据访问，并配套浏览、可视化和分析工具。你可以按蛋白/核酸名称、结构编号、配体等检索结构并查看实验来源与结构细节。常用于结构生物学学习、构效关系分析、对接/突变设计的结构参考。

图片来源：PDB官网

9. BRENDA(www.brenda-enzymes.org)

BRENDA以酶与反应信息为核心，可围绕EC编号、底物/产物、反应式与通路等进行检索与汇总。其相关模块也支持将不同来源的生化反应进行匹配整合，并提供下载与参考文献追溯，便于做代谢反应层面的整理。常用于查酶催化反应关系、反应在不同通路/数据库中的对应、以及进行反应数据的汇集与比对。

图片来源：BRENDA官网

10. KEGG(www.kegg.jp)

KEGG用于从分子层面数据理解生物系统功能，核心内容包括通路(PATHWAY)、基因/蛋白(GENES)、化合物(COMPOUND)等模块。它提供映射与注释工具(如 KEGG Mapper、KO/通路相关工具)来把你的基因或代谢物列表投到通路图上进行解释。常用于通路富集解读、功能注释、代谢网络梳理与可视化。

图片来源：KEGG官网

11. CHOPCHOP(https://chopchop.cbu.uib.no/)

CHOPCHOP是基因组编辑靶点设计工具，可为CRISPR/Cas9、Cpf1/Cas12、Cas13以及TALEN等模式选择靶位点并给出候选gRNA，它会提供脱靶相关信息(如不同错配条件下的潜在脱靶数量)并支持更细的高级参数设置。常用于CRISPR实验前期方案设计、gRNA备选列表生成与脱靶风险评估。

图片来源：CHOPCHOP官网

12. Salis Lab(salislab.net)

Salis Lab以从DNA序列预测基因表达为研究方向，并在网站上提供相关模型与工具入口。其GeneticSystemsCalculator/RBS Calculator等工具可用于遗传元件与表达调控相关的设计与计算支持。常用于合成生物学或表达优化场景，把设计从经验驱动更进一步变成可计算与可验证。

图片来源：Salis Lab官网

13. Addgene(www.addgene.org)

Addgene是非营利性质粒资源库，核心功能是帮助科研人员存储、共享并分发质粒等研究材料，同时提供对应的序列与材料信息。平台支持实验室提交(deposit)与全球范围申请获取材料，并配套材料信息检索与文档支持。常用于快速获取常用载体、CRISPR 工具质粒、报告系统等标准化材料。

图片来源：Addgene官网

14. NEBcutter(https://nc3.neb.com/NEBcutter/prj/)

NEBcutter(是NEB提供的免费在线限制性内切酶分析工具)，用来在你输入的DNA序列中自动识别限制性酶切位点并生成酶切图谱。它会统计每种酶在序列中的切割次数(例如 0 次、1 次、多次)，并标注部分酶对甲基化状态的敏感性，帮助你判断某段DNA是否会因甲基化影响酶切结果。它还能把结果图导出为PDF/SVG等格式，方便直接用于实验记录或报告，并提供跳转到 REBASE 等数据库查看酶的更多信息。

图片来源：NEBcutter官网

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