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碱基编辑质粒（Base Editor） 先导编辑质粒（Prime Editing，PE）
1. 碱基编辑质粒（Base Editor）
表格
| 质粒名称 | Addgene 编号 / 备注 | 功能说明 |
|---|---|---|
| XCas9(3.7)-ABE(7.10) | 108382 | 单碱基 A→G 替换，David Liu 课题组经典 ABE 编辑器 |
| NG-ABE8e | 138491 | NG PAM 兼容高效腺嘌呤碱基编辑器，编辑窗口更广 |
| pCAG-CBE4max-SpRY-P2A-EGFP(RTW5133) | 139999 | CBE 胞嘧啶编辑器，SpRY 无 PAM 限制，带 EGFP 荧光标记 |
| pCMV-T7-ABEmax(7.10)-SpRY-P2A-EGFP(RTW5025) | 140003 | ABEmax 腺嘌呤编辑器，SpRY 广谱 PAM，T7 体外转录 + EGFP |
| BPK1520 | 65777 | 早期经典 CBE 胞嘧啶碱基编辑骨架质粒 |
2. 先导编辑质粒（Prime Editing，PE）
表格
| 质粒名称 | Addgene 编号 / 备注 | 功能说明 |
|---|---|---|
| pCMV-PEmax-P2A-hMLH1dn | 174828 | 优化型 PEmax，搭配显性负突变 hMLH1 提升编辑效率 |
| pU6-tevopreq1-GG-acceptor | 174038 | PE 专用 pegRNA 表达骨架，U6 启动子 |
| pLenti-PE2-BSD | 161514 | 慢病毒型 PE2，含 BSD 博来霉素筛选标记，适合稳转细胞株 |
| pCMV-PE2-P2A-GFP | 132776 | 初代 PE2 编辑器，带绿色荧光 GFP，方便流式分选阳性细胞 |
| pCMV-PE2 | 32775 | David Liu 原始初代 PE2 核心质粒 |
| PU6-gRNA-accepter | 132777 | U6 驱动 pegRNA / 引导 RNA 通用空载骨架 |
| pCMV-PEmax-P2A-BSD | 174821 | PEmax 优化先导编辑器，BSD 药物筛选标记 |
| v3em-Cterm-PE2max-ΔRNaseH-dualU6 | 198735 | 体内专用 PE2max，截除 RNaseH，双 U6 共表达 pegRNA |
| v3em-Nterm-PE2max | 198734 | 体内递送 PE2max 载体，N 端改造适配体内转染 |
| pCMV-PE6c | 207853 | 新一代 PE6c 先导编辑器，大幅降低副产物 |
| v3em-Cterm-PE6c-dualU6-Rosa26-twinPE-attB | 207861 | 体内定点整合 twinPE 双先导编辑载体，可靶向 Rosa26 位点 |
| SpRY-PEmax-BSD | 自主构建 | SpRY Cas9 变体，无 PAM 限制 PEmax，BSD 筛选，靶向范围极大拓展 |
| NG-PEmax-BSD | 自主构建 | NG PAM 兼容 PEmax，克服传统 NG Cas9 狭窄靶向限制 |
二、分类
碱基编辑（Base Editor）
ABE 系列：仅实现 A-T → G-C 单碱基转换，无双链 DNA 断裂，脱靶风险低于 CRISPR-Cas9；SpRY 变体可识别几乎所有 PAM 序列，解决传统 NG/SpCas9 靶向局限。
CBE 系列：实现 C-G → T-A 转换，BPK1520 为初代骨架，CBE4max 为高活性优化版本。
适用场景：点突变疾病建模、单碱基致病突变修复、基因沉默 / 激活（终止密码子引入）。
2. 先导编辑（Prime Editing, PE）
核心优势
不产生 DNA 双链断裂，可精准实现所有单碱基替换、小片段插入 / 缺失，无 indel 副产物、无脱靶大片段缺失，覆盖碱基编辑无法实现的编辑类型（如 C→G、T→A、短片段插入删除）。
质粒亚型分工
初代 PE2（32775/132776）：基础工具，体外细胞基础验证使用；
PEmax 系列（174828/174821）：密码子、连接肽优化，编辑效率较 PE2 提升数倍；搭配 hMLH1dn 可抑制细胞错配修复通路，进一步提升编辑效率；
慢病毒载体 pLenti-PE2-BSD：用于构建稳定表达 PE 的细胞系，BSD 筛选；
体内专用 v3em 系列（198734/198735/207861）：适配 AAV / 脂质体体内递送，ΔRNaseH 改造降低体内免疫应激，dualU6 同步表达 PE 蛋白与 pegRNA；twinPE 载体可实现大片段基因精准替换；
广谱 PAM 自主构建载体（SpRY-PEmax、NG-PEmax）：突破传统 SpCas9 NGG PAM 限制，基因组靶向位点覆盖度提升 3~10 倍，适合无 NGG 位点的基因编辑靶点。
配套骨架
pU6 系列空载仅用于克隆 pegRNA（引导编辑模板 RNA），与 PE 蛋白表达质粒共转染使用。
三、补充使用建议?
细胞体外实验首选：
单碱基突变：SpRY-ABEmax-EGFP（#140003）/ CBE4max-SpRY（#139999）；
任意类型精准编辑：pCMV-PEmax-P2A-GFP /pCMV-PEmax-BSD；
体内动物实验：优先 v3em 系列改造 PE2max/PE6c 载体；
稳转细胞株构建：选用 pLenti-PE2-BSD 慢病毒载体；
稀有靶点（无 NGG PAM）：使用自主构建 SpRY-PEmax-BSD / NG-PEmax-BSD；
pegRNA 克隆：统一使用 pU6-tevopreq1-GG-acceptor（#174038）空载。
